请问现在考研是不是考的都是学科门类下的二级学科呢？

关于你的问题：
一、大学本科学习的既有一级学科的内容，也有二级学科即专业的内容。所以，本科也是要选专业的。至于到研究生阶段，可能每个专业还会细分多个研究方向，也就是说分的更细。比如历史学专业分为8个研究方向，即世界史、中国古代史、中国近现代史、历史地理学、专门史、史学理论与史学史、历史文献学、考古及博物馆学等，但它们这些方向不管读哪个，仍然都属于历史学专业。只是研究方面，更体现学术有专攻。
二、不管本科、硕士、博士，都是按专业招生的。如你所说，同一个二级学科可以产生硕士和博士。

三、研究生分全日制研究生和在职研究生两种。全日制研究生，除了做研究和实践，在大学是有课程的，需要上课。在职研究生，则采取一个月集中几次上课的方式，平时自己学习。

四、考研的教材，一般就是用本科的教材。每个学校都有指定书目，把指定范围的书籍看懂弄透即可。
五、从考研角度，本科与专科的主要的区别在于，本科重视学术，专科则偏重于实践。本科有体现学术研究水平的论文答辩，而专科没有。正因为如此，专科缺乏证明其学术能力的学位证书，所以不能直接考研。

PS：在研究生阶段，同一个专业也就是你说的二级学科，课程更高级。比如本科学习的计算机应用，研究生阶段要学习高级应用；还比如外语，本科阶段是通用英语培养，研究生阶段要学专业外语等。