这是一个颇具争议的问题。
2008年最新的全国研究生院排行榜发布后，有以下两种结果：
1、包含所有的研究机构和高等院校在内：中科院研究生院排名高居榜首；
2、仅高等院校的研究生院进行对比排名：清华的研究生院排名九年连冠。
具体你可以看看这个网页
http://edu.qq.com/y/yzt/08ytop.shtml但我个人其实一直很疑惑的一个问题是:如果仅高等院校的研究生院进行对比排名来看，北大研究生院要远远优于清华研究生院，北大在文学、理学、经济学、社会科学、哲学、医学、历史学等7个专业领域都是排名第一，而清华研究生院只在工学、管理学、自然科学等这3个专业领域排名第一，这样看来北大居然非常明显的优势，但不知道为什么每次却总是把北大排在清华后面！！！难道这个社会真的就是“重工轻文”？
理论上讲，中科院研究生院的科研实力应该更强一些，清华在这方面肯定不如。不过要上学的话，我觉得去清华应该比去中科院要好一些吧，中科院研究生院的是纯研究性机构，估计要比清华大学这样的校园气氛差得很远！清华是知名高校，在校园文化、学习气氛、人文活动等方面我觉得应该要比中科院研究生院要好很多！
当然，上述只是我的个人观点。
